段莉莉，女，博士，教授，博士生导师，山东“省属优青”获得者。2006-2010年在南京大学理论与计算化学研究所从事访问学者研究。2010-2012年山东师范大学物电星空在线登录,星空（中国），讲师。2012-2017年山东师范大学物电星空在线登录,星空（中国），副教授，硕士生导师。2018年-至今，山东师范大学物电星空在线登录,星空（中国）教授，博士生导师。主要从事原子和分子层次上的蛋白质理论与动力学模拟研究。在《J. Am. Chem. Soc.》、《J. Phys. Chem. Lett.》、《J. Chem. Inf. Model.》、《Int. J. Biol. Macromol.》、《Phys. Chem. Chem. Phys.》、《J. Chem. Phys.》、《Nanoscale》、《Appl. Phys. Lett.》等国际知名期刊发表SCI论文60余篇，成果得到了国内外同行的广泛关注。其中以第一作者发表的两篇JACS属于本领域顶级TOP期刊 (一区论文，IF: 15.419)。2篇论文入选 “ESI高被引论文”，4篇论文入选 “热点论文”，授权发明专利1项。目前主持国家自然科学基金面上项目1项，山东省自然科学基金面上项目1项。主持完成国家自然科学基金面上项目(2项)、国家自然科学基金青年基金、国家自然科学基金理论物理专款基金、山东省人才基金项目：省属优青、博士后科学基金特别资助及面上项目等10余项国家级和省部级课题。
研究方向
1. 病毒蛋白与药物相互作用机制及能量计算 2. 生物分子结构和功能的计算模拟 3. 蛋白质折叠机理的量子理论计算研究 4. 计算机辅助药物设计
科研项目
1. 国家自然科学基金面上项目：(12474285、2025.01-2028.12)、主持、在研
2. 山东省自然科学基金面上项目：(2025.01-2027.12)、主持、在研
3. 国家自然科学基金面上项目：(11774207、2018.01-2021.12)、主持、完成
4. 国家自然科学基金面上项目：(11574184、2016.01-2019.12)、主持、完成
5. 人才基金-省属优青: (ZR2016JL003、2016.11-2019.11)、主持、完成
6. 国家自然科学基金青年基金：主持、完成
7. 国家自然科学基金理论物理专项：主持、完成
8. 中国博士后特别资助项目：主持、完成
9. 华东师范大学精密光谱科学与技术国家重点实验室开放课题：主持、完成
10. 山东省优秀中青年科学家奖励基金：主持、完成
论文成果
发表SCI论文60余篇，以第一/通讯作者发表SCI论文50余篇，论文被引用次数1000余次。
5篇代表性论文如下：
•1. Duan L. L.; Liu X.; John Z. H. Zhang*, “Interaction Entropy: A New Paradigm for Highly Efficient and Reliable Computation of Protein−Ligand Binding Free Energy”, J. Am. Chem. Soc. 138: 5722-5728. (2016).
•2. Duan L. L.; Mei Y.; Zhang D. W.; Zhang Q. G.; John Z. H. Zhang*, “Folding of a Helix at Room Temperature Is Critically Aided by Electrostatic Polarization of Intraprotein Hydrogen Bonds”, J. Am. Chem. Soc. 132(32):11159-11164. (2010).
•3.Xiong D. Y.; Zhao X. Y.; Luo S.; Cong Y. L.; John Z. H. Zhang*; Duan L. L.*, “Immune Escape Mechanisms of SARS-CoV-2 Delta and Omicron Variants Against Two Monoclonal Antibodies that Received Emergency Use Authorization”, J. Phys. Chem. Lett. 13, 6064−6073 (2022).
•4. Xiong D. Y.; Zhao X. Y.; Luo S.; John Z. H. Zhang*; Duan L. L.*, “Molecular Mechanism of the Non-Covalent Orally Targeted SARS-CoV‑2 Mpro Inhibitor S‑217622 and Computational Assessment of Its Effectiveness against Mainstream Variants”, J. Phys. Chem. Lett. 13, 8893−8901 (2022).
•5. Xu X. L.; Luo S.; Zhao X. Y.; Tang B. L.; Zhang E. H.; Liu J. X.; Duan L. L.*, “Computational analysis of PD-L1 Dimerization Mechanism Induced by Small Molecules and Potential Dynamical Properties”, Int. J. Biol. Macromol. 265, 130921 (2024).
荣誉奖励
1. 2011年获山东省优秀博士论文。
2. 2013年度获得山东省高等学校优秀科研成果奖一等奖（第一完成人）。
3. 2015年度获得山东省高等学校优秀科研成果奖二等奖（第一完成人）。
4. 2016年度获得山东省高等学校科学技术奖一等奖（独立完成人）。
5. 2018年度获得山东首届物理学会优秀青年学术奖（独立完成人）。
6. 2020年度获得山东省高等学校科学技术奖一等奖（第一完成人）。
招生方向
硕士研究生招生专业：物理学、原子与分子物理
博士研究生招生专业：物理学、原子与分子物理
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